Respecto a la fauna, este ecosistema marítimo-terrestre alberga una de las mayores colonias españolas de gaviota patiamarilla y de cormorán moñudo, además de un gran número de muchas otras aves marinas, lo que ha hecho que el Parque sea declarado como Zona de Especial Protección para Aves (ZEPA). En los acantilados se puede observar el halcón peregrino, el vencejo real, los cuervos.... Y en el interior de la isla: el petirrojo, el chochín y el mirlo, entre otros.

Los mamíferos más abundantes son el conejo, el erizo común, la nutria y la musaraña. Los anfibios son muy escasos, mientras los reptiles son muy abundantes. Peces, moluscos y crustáceos pueblan sus fondos marinos.