Aunque fue creado en 1933, desde el año 2006 está instalado en su sede actual. Ocupa un edificio de estilo contemporáneo de tres plantas, cuyo luminoso interior, a diferentes alturas y con un vistoso artesonado de madera, se organiza en torno a un gran vestíbulo y una escalera doble. Contiene importantes y variados fondos arqueológicos, en su mayor parte procedentes de diversos yacimientos de la provincia de Almería, desde los primeros pobladores hasta la actualidad. Cuenta también con una amplia colección de etnografía: cerámica popular, trajes regionales, armas, elementos de esparto, etc. Los dos ámbitos más destacados son los dedicados a las culturas de Millares y El Argar, del II y II milenio antes de nuestra era, dos momentos históricos que han marcado la perspectiva histórica de la provincia y del Sureste peninsular.