Es uno de los grandes centros de referencia sobre fauna española y mediterránea. Las colecciones de los naturalistas españoles de los siglos XVIII y XIX se suman a una muestra didáctica que se complementa con una actividad científica en la vanguardia de la investigación. El museo es heredero del Real Gabinete de Historia Natural, fundado en 1771 por Carlos III. En la actualidad guarda más de 6 millones de ejemplares conservados en sus diferentes colecciones.